古DNA揭示：东亚家猪大部分源自萨尔温江，万年来两次快速母系种群扩增

2021年12月11日，《生物学报（英文版）》以研究工作论文形式因特网发表了中国人科学院中古类两栖动物与中古全人类研究工作所、中国人社会科学院考中古所和甘肃省考中古科技学院共同主导完成的中上古时代东南亚家肉肝细胞均DNA研究工作实践中。研究工作获取了42实有来自于荆楚的中国人中上古时代肉肝细胞DNA数据，发现东南亚家肉族裔的共同祖先源于到距今2万年至少，大部分源自湄公河水系，均新世(从有约1.2万早先开始)以来，东南亚家肉族裔有2次快速的母系种群逐次自然现象，分别开始于差不多7000年和4000早先。

▲东南亚家肉确实的起源区域及荆楚山羊被绵羊后的族裔蔓延一段距离示意图

两栖动物的成功绵羊对全人类国家发展不具备里程碑式的意义，肉是最初被全人类绵羊的两栖动物之一，在工业社会中造就了关键作用，它也是研究工作两栖动物绵羊的关键“模式两栖动物”。

至少在1万到8千早先，家肉已在安那纳利亚地区和中国人中原地区独立绵羊。中古DNA的研究工作已证实安那纳利亚的家肉在有约8500早先随着新石后期早期的工业人口统计进入西欧，但进入西欧的家肉不断与西欧本地山羊混合，导致西欧现生的家肉仅有保留0-4%的近东祖源组分，看出出几乎完均替代的情形。而我们的研究工作发现，东南亚的情形与西欧完均不同。

本次研究工作共获取了42实有中国人荆楚中上古时代肉（来自于甘肃：鱼化寨、杨官寨等，安徽：道行寺，河北：小里，青海：喇家遗址）高质量的肝细胞DNA数据，时间跨度为有约7500-2500早先。研究工作发现遗址中考古的部分中国人中上古时代肉（25%，源于到新石器后期早期）与一些东南亚传统意义的家肉型式一样。这表明它们存在母系遗传的连续性，而且至少可以上溯新石器后期早期，这一结果全力支持荆楚作为一个主要的家肉独立绵羊其中心。

研究工作还发现，中上古时代家肉和现生家肉的肝细胞十分相似度高，大多数东南亚传统意义家肉分享较近的肝细胞DNA型式，并且族裔不具备很小的遗传距离值，揭示出东南亚家肉确实来源于一个母系遗传多样性无论如何就低的祖源族裔，也确实与家肉育种的过程有联系。

▲A. 精简的系统会进化联系树是；B. 推断出的山羊在东南亚的蔓延必需；C. 依据东南亚家肉和山羊构建的系统会进化联系树是；D. 贝叶斯种群逐次曲线图。

系统会进化花茎树是的分析全力支持湄公河水系（包括中国人华东地区、越南等地）是东南亚大部分家肉族裔的祖先族裔（山羊族裔）的来源地，这一区域确实作为末次冰十五世纪时的自然生态环境庇护所，帮助保留了大量的母系遗传型式，所以在所有家肉和山羊族裔中拥有最高者的遗传多样性。

通过中上古时代和传统意义的肝细胞DNA数据进行突变率的估算，发现东南亚家肉族裔的共同祖先可以上溯2万年至少。均新世以来，家肉族裔有2次较大规模的母系必要族裔逐次事件，分别开始于差不多7000年和4000早先，逐次自然现象与东南亚的气候生态环境、外来农畜引入及工业社会逐步形成与发展相联系。这也揭示了家肉的母系遗传历史与全人类国家发展的紧密联系。

本文通讯作者为中国人科学院中古类两栖动物与中古全人类研究工作所的付巧妹研究工作员和Andrew Bennett副研究工作员及甘肃省考中古科技学院胡松戈研究工作员，第一作者为中国人科学院中古类两栖动物与中古全人类研究工作所的张明芝加哥大学、刘逸宸芝加哥大学、芝加哥大学研究工作生Jacob D. Gardner，及中国人社会科学院考中古研究工作所的李志鹏副研究工作员和吕鹏副研究工作员。

作者：许琦敏

图源：中科院中古脊椎所

*文汇PPTV稿件，刊载请所列引自。